Генотипизација и фенотипизација могу идентификовати и чак предвидети, отпорност на ХИВ ХИВ
Чак и за људе са оптималним придржавањем терапије, очекује се да ће се одређени степен отпорности према лековима ХИВ-а временом развити због природних мутација вируса. У другим случајевима, отпор може брзо да се развија када се субоптимално придржавање омогућава успјешним популацијама ХИВ-а, што доводи до неуспјеха лијечења.
Када дође до неуспјеха лијечења, морају се одабрати алтернативне комбинације лијека како би се потиснула ова нова популација резистентног вируса.
Тестирање генетичког отпорности помаже у томе да идентификује типове резистентних мутација у "виралном базену" особе, док утврђује колико су вируси који су подложни могућим антиретровиралним агенсима .
За тестирање генетичке резистенције у ХИВ-у користе се два примарна средства: генотипски тест ХИВ и фенотипски тест ХИВ-а .
Шта је генотип и фенотип?
По дефиницији, генотип је једноставно генетски састав организма, док је фенотип видљиве карактеристике или особине тог организма.
Генотипска анализа (или генотипизација) функција идентификовањем наслеђених инструкција унутар генетског кодирања ћелије или ДНК. Фенотипске анализе (или фенотипизације) потврђују израз ових инструкција под утицајем различитих услова у животној средини.
Иако веза између генотипа и фенотипа није апсолутна, генотипизација може често бити предвидљива за фенотип, нарочито када промјене у генетичком коду дају очекиване промјене у особинама или карактеристикама - као иу случају развоја отпорности на лекове.
Фенотипизација, с друге стране, потврђује "овде и сад". Циљ је процјена реакције организма на специфичне промјене притиска на животну средину - као што је када је ХИВ изложен различитим љековима и / или концентрацијама лијекова.
Објашњавање генотипизације ХИВ-а
Генотипизација ХИВ-а је углавном најчешћа технологија која се користи за тестирање отпорности.
Циљ анализе је откривање специфичних генетских мутација у гаг-пол региону генома вируса (или генетског кода). Ово је подручје гдје су ензими реверзне транскриптазе, протеазе и интегазе - мете већине антиретровиралних лијекова - кодирани на ланцу ДНК.
Прво појачавање генома ХИВ-а користећи технологију полимеразне ланчане реакције (ПЦР) , лабораторијски техничари могу секвенцирати (или "мапирати") генетику вируса користећи различите технологије откривања мутација.
Мере ових теза (или акумулације мутација) тумаче техничари који анализирају однос између идентификованих мутација и очекиване подложности вируса на различите антиретровирусне лекове. Онлине базе података могу помоћи помоћу упоређивања секвенце тестирања са прототипом "дивљег типа" вируса (тј. ХИВ који не садржи резистентне мутације).
Тумачење ових тестова користи се за одређивање осетљивости на лекове, са већим бројем кључних мутација које доводе до виших нивоа отпорности на лекове .
Објашњавање фенојетирања ХИВ-а
Фенотипизација ХИВ процењује раст ХИВ-а особе у присуству лекова, а затим упоређује то са растом контролног вируса дивљег типа у истом леку.
Као и код генотипских анализа, фенотипски тестови појачавају гаг-пол регион ХИВ генома.
Овај одељак генетског кода се онда "пресадио" на клон дивљине типа помоћу технологије рекомбинантне ДНК . Добијени рекомбинантни вирус се користи за заразе ћелије сисара ин витро (у лабораторији).
Вирусни узорак је затим изложен растућим концентрацијама различитих антиретровиралних лијекова док се не постигне 50% и 90% вирусна супресија. Концентрације се затим упоређују са резултатима контроле, узорка дивљег типа.
Релативне "фолдове" промене обезбеђују опсег вриједности према којој се одређује осјетљивост на лекове. Четворострука промена једноставно значи да је четири пута већа количина лијека потребна за постизање супресије вируса у поређењу са оном дивље врсте.
Што је већа вриједност фолда, мање је осјетљива за одређени лек.
Ове вредности се затим стављају у нижи клинички и горњи клинички опсег, а горње вредности доводе до виших нивоа отпорности на лекове. (Види извештај о узорку .)
Када је извршен тест генетичке резистенције?
У Сједињеним Америчким Државама, тестирање генетског отпорности се традиционално врши на пацијентима који нису били на терапији да би утврдили да ли имају "стечену" отпорност на лекове. Студије у САД указују на то да ће између 6% и 16% преноса вируса бити отпорно на најмање један антиретровирусни лек, док ће скоро 5% бити отпорно на више од једне класе лека.
Тестирање генетског отпорности се такође користи када се сумња да је отпорност на лекове код појединаца на терапији. Тестирање се врши док пацијент узима неуспешан режим или у року од четири недеље прекида терапије ако је вирусно оптерећење веће од 500 копија / мЛ. Генотипско тестирање је углавном пожељно у овим случајевима пошто они коштају мање, имају брже време провере и пружају већу осјетљивост за откривање мјешавина дивљег и отпорног вируса.
Комбинација фенотипског и генотипског тестирања је углавном пожељна за особе сложене отпорности на више лекова, посебно за оне који су изложени инхибиторима протеазе .
Извори:
Светска здравствена организација (ВХО). "Лист извјештаја о отпорности на ХИВ". Женева, Швајцарска; 11. април 2011.
Ким, Д .; Зиебелл, Р .; Садувала, Н .; ет ал. "Тренд у преносивим мутацијама повезаним са резистентним ХИВ-1 АРВ: 10 подручја за надгледање ХИВ-а, САД, 2007-2010." 20. конференција о ретровирусима и опортунистичким инфекцијама. Атланта, Георгиа; 6. марта 2013; Усмени сажетак 149.
Национални институти за здравље (НИХ). "Смјернице за кориштење антиретровиралних средстава код одраслих и адолесцената инфицираних ХИВ-ом". Бетхесда, Мериленд; 11. октобар 2013.